Да, так и есть, это сделано специально (это не баг, это фича

). И относится не только к архам.
При обновлении - обновляется только открытая сейчас сота; так, если открыта домашняя, то колония не обновляется. При этом, сообщения приходят для всех сот. Но открыв колонию - вы увидите недостроенные здания, не придут архи, не добавятся ресурсы...
Читайте новости!