Если во время боя на соте придет две армии на защиту, то как будет рассчитываться урон нападающему: с учетом порядка их прихода и индивидуально или просто, как сумма пришедших юнитов?

и второй вопрос: в той же самой ситуации, кто уничтожает прослой у атакующего, внутренняя армия или первая пришедшая на подмогу?

Как я понял - пляска здесь идет от атакующего, т.е. все армии, которые прибудут до завершения очередного раунда получат урон одновременно в конце ранда, причем каждая - независимо от остальных армий.
Совсем другое дело, когда армии приходят атаковать - здесь для каждой армии завязывается свой раунд и каждая из армий получит урон в конце своего раунда.