1. апгрэйдить можно не все здания.
Зайди в портал. Там в меню выбери Помощь, Обзор зданий, свою расу и увидиши какие здания можно апгрейдить и что для этого нужно.
и сюда тоже можешь зайти:
http://forum.destinysphere.ru/forum/techtree5.html
2. В научном центре левее кнопки Обучить есть текстовое поле, куда нужно ввести количество ученых и нажать на эту кнопку и постепенно они будут прибавляться к твоим 63.